IsoPlexis: Líder en proteómica Single Cell
IsoPlexis es lo último en una serie de herramientas en el ámbito de biociencias, ofreciendo análisis de proteómica funciona Single Cell. Esta tecnología consiste de 3 partes: chips, hardware y software de análisis. Pese a sonar sencillo, el equipo es capaz de analizar el Paisaje Inmume Funcional (Secretoma Single Cell), Ómica Intracelular (señalización intracelular/metaboloma Single Cell) y biofluidos por Bulk ELISA altamente multiplexado. Estos ensayos se realizan completamente automatizados desde la carga de los chips hasta el final del ensayo, y finalmente, el software IsoSpeak analizará los datos produciendo datos procesados y gráficas publicables.
Para ilustrar el poder de la tecnología de IsoPlexis, una publicación reciente en Nature Medicine se puede usar como ejemplo. Utilizando la plataforma IsoLight para analizar single cells, los investigadores obtuvieron resultados PSI (Índice de Fuerza Polifuncional por sus siglas en inglés) por medio del software IsoSpeak de IsoPlexis, creando la gráfica publicada como se presenta en la Fig. 4j. Todos estos procesos no requieren análisis externos por otros departamentos, optimizando recursos.
El objetivo del ensayo de Fase 1 era analizar el efecto de un CAR CD19/22 biespecífico en prognosis en situaciones donde depleción de CD19 ocurre in vivo, dando lugar a una reducción en remisión completa. Uno de los ensayos realizados fue estimular NALM6 (CD19, CD22 o CD19/22 doble knockout), un precursor de célula B de leucemia, con células CAR-T (CAR biespecífico CD19/22 o monoespecífico CD22) purificadas por CD4+ o CD8+ para detectar variaciones en PSI single cell.
Resulta claro que la polifuncionalidad de células NALM6 fue menor con CAR biespecífico CD19/22 comparado con el monoespecífico de CD22 en células NALM6 CD22 knockout estimuladas tanto en condiciones de poblaciones purificadas de CAR-T CD4+ o CD8+. Además TNFα e IL2 fueron secretadas a mayores niveles en células NALM6 CD22 competentes estimuladas con CAR-T CD22 monoespecífico frente a CAR biespecífico.
Esto da lugar a la cuestión del efecto de potencia vs redundancia de CAR-T biespecífico frente a monoespecífico, en la que el monoespecífico tuvo un PSI más potente, pero con al depleción de la diana, el PSI muestra un perfil secretorio altamente reducido, el cual al comparar con estimulación biespecífica CD19/22 pudo mantener polifuncionalidad en condiciones de depleción de CD19 o CD22. Además, los investigadores con respecto al uso de tecnología IsoPlexis en ingeniería CAR-T indican:
“engineering iterations should be guided by careful studies of single-cell CAR polyfunctionality incorporating cytokine production as a critical quality attribute”